坚持创新引领，以“厚研求是、创新强农”为院训，紧扣“科研设施先进、科研基地完备、科研保障有力、科研人才济济、科研成果丰硕”五大目标，实现科研创新能力、科技储备能力、科技服务能力、成果转化能力大提升，建设成全省一流、大湘西领先、全国具有影响力的市级农业科学院，出色服务怀化农业现代化。

设办公室、党群人事部、计划财务部、科研管理与技术推广部等4个管理部室，设水稻所、中药材研究所、果树研究所、茶叶研究所、蔬菜花卉研究所、畜牧水产研究所、旱作研究所、生物技术研究所、农业装备与食品加工研究所、农业农村经济研究所等10个研究所。

人才队伍：截止2021年底，全院有在职人员61人。在职人员中，副高以上职称11人，中级职称9人；在读博士1人，硕士10人，本科27人，另引进柔性人才4名，为全省行业技术专家,有市级科技特派员10人，市粮食生产专家组成员4人，市专家库10人。

建设有国家级农作物品种审定区域试验站、湖南省旱粮产业技术体系怀化试验站、湖南省蔬菜产业技术体系湘西试验站等3个国家、省级科研试验站；有饲料安全与高效利用教育部工程研究中心怀化技术推广中心、稻谷及副产物深加工国家工程实验室怀化技术推广中心；有杂交水稻种质资源创新、生态农业生物技术、旱粮轻简栽培技术等3个市级重点实验室；有顺福水稻育种、高新区畜牧和经济作物研究、下坪旱粮试验、芦坪蔬菜试验、双溪水稻区域试验、黄岩水稻抗性鉴定、海南南繁试验等7个科研基地；院内建有一栋面积800㎡，配备实验仪器400多台（套）的综合科研实验楼。

改革开放以来，共获国家、省、市重大科技成果奖80项次，其中国家级奖6项次，省部级奖30项次，1981年，参与研究的“三系法籼型杂交水稻”获国家技术发明特等奖，1996年自主选育的“湘早籼7号”获国家科学技术进步三等奖；取得国家农作物新品种权6项，通过国家、省审定农作物新品种50多个，其中水稻品种32个，油菜品种10多个，马铃薯品种6个；研究、引进、集成创新并示范、推广农业新技术400多项。据统计，新品种新技术累计推广面积1.5亿多亩，累计产生社会经济效益210亿元。

宣传国家和地方关于农业科技和农业技术推广方面的法律法规；开展农业农村经济研究，为党委政府制定农业农村政策提供参谋咨询；承担国家、省作物品种区域试验任务，为农作物新品种审定提供技术依据；为全市农业优势特色产业规划和发展提供技术支撑；为全市种业安全、粮食安全、农产品质量安全、农业防灾减灾等重要工作提供技术支撑；承担上级下达的农作物种质资源调查、收集、保护工作任务；负责全市农业产业技术体系相关学科的基础性、应用性、公益性研究，承担国家、省农业产业技术体系建设任务，承担国家、省、市农业科研攻关课题及指令性科研任务；承担全市农作物种质资源创新利用工作；开展应用型农业生物技术研究、农业生化检验分析、本市特异种质资源筛选评价和重要基因发掘工作；承担水稻、果树、旱粮、中药材、茶叶、蔬菜、油料等农作物的育种技术研究；开展本地特色农作物品种培育技术研究，推进分子技术、基因编辑、合成生物学、人工智能等新技术在作物育种上的应用；承担农作物栽培、植物保护、土壤肥料等生产技术的研究与应用；承担畜禽水产绿色高效养殖技术研究与应用；承担地方特色畜禽水产品种的改良、繁育、疾病防控等技术的研究与应用；承担农业机械化、设施农业、智慧农业技术研究与推广应用，开展农牧渔及其副产品精深加工技术研究与应用；承担农业技术推广职能，制订实施农业技术推广计划；开展新品种、新装备、新农艺的引进、试验、示范和推广工作；承担农业技术培训、指导及技术资料的编发；承担现代农业管理模式、农业产业发展规划等研究，开展农业经济、农业科技信息收集分析工作；组织开展农业学术交流、技术合作和科研人才培养工作。